Em termos de Linhas de Investigação e grupos de trabalho, o CICS apresenta alguma diversidade de eixos temáticos: (i) População, Família e Saúde (PFS), (ii) Organizações, Território e Desenvolvimento (OTD), (iii) Trabalho, Desigualdades e Políticas Públicas (TDPP) e (iv) Cultura, Ciência e Identidade (CCI), com projetos de investigação em curso cujas questões podem ser sintetizadas do seguinte modo:
1- Como caracterizar a evolução e as tendências sócio-demográficas designadamente em termos de morbilidade e mortalidade e que modo e em que medida a (não) posse de recursos, as condições económicas e sociais e o factor género, por um lado e, por outro, as infraestruturas, equipamentos e cuidados de saúde condicionam ou influenciam o grau de bem-estar das populações e de que modo as famílias e comunidades locais contribuem para esse bem-estar, sendo dado particular enfoque investigativo aos processos de envelhecimento, saúde e qualidade de vida dos idosos (Linha de investigação PFS);
2- Como compreender e interpretar o fenómeno organizacional, seu enraizamento territorial, impactos, modalidades e objectivos em termos de desenvolvimento e atitudes, quais os processos de conservação e mudança nas organizações hodiernas (empresariais, autárquicas), que tipos de liderança e de que modo os actores institucionais e outros podem contribuir para o bem estar e qualidade de vida das populações (Linha de investigação OTD);
3- Em que medida o trabalho detém uma centralidade nas sociedades e nas trajectórias biográficas das pessoas e, simultaneamente, em que medida a divisão social do trabalho constitui uma das bases das desigualdades sociais e de que modo se articulam com outras formas de desigualdade social (étnicas, de género, educacionais, territoriais) visíveis na segmentação do mercado de trabalho, no desemprego, na precariedade e noutras situações de pobreza e exclusão social e, por fim, perante determinados diagnósticos, em que medida existem políticas públicas visando equidade e justiça social a nível local-regional, nacional e internacional (Linha de investigação TDPP);
4- Quais as (inter)relações entre cultura, ciência e identidades (em termos de nacionalidade, sexualidade, género e respectivas trajectórias pessoais e científicas) no quadro da modernidade e dos processos de modernização, assim como dos efeitos da ciência e da tecnologia sobre crenças religiosas e correlativa secularização, sendo igualmente problematizados os usos da (bio)tecnologia: não só os seus benefícios como os riscos e incertezas em termos ambientais, da alimentação, da saúde e dos propósitos forenses ou ainda de controlo e regulação política (Linha de investigação CCI).